Колоноскопические аспирационные лаважи для метатаксономического профиля слизистой оболочки спондилоартрита

Том 13 научных отчетов, номер статьи: 7015 (2023) Цитировать эту статью

540 доступов

5 Альтметрика

Подробности о метриках

Изучение микробиоты желудочно-кишечного тракта пациентов со спондилоартритом (СпА) было сосредоточено на анализе образцов фекалий, которые в основном отражают просветную микробиоту. Целью этого исследования было определить вклад микробиома слизистой оболочки и просвета кишечника в дисбактериоз кишечника при СпА, используя аспирационные лаважи при колоноскопии (CAL), недавнюю альтернативу региональным исследованиям желудочно-кишечного тракта. Мы проанализировали 59 CAL (из сигмовидной кишки и дистального отдела подвздошной кишки) и 41 образец кала от 32 пациентов со СпА и 7 здоровых людей, используя метатаксономическое профилирование, нацеленное на ген 16S рРНК. Установлена ​​высокая распространенность проявлений со стороны ЖКТ среди больных СпА (65,3%). Метатаксономическое профилирование подтвердило, что образцы CAL из нижних отделов желудочно-кишечного тракта (толстая или подвздошная кишка) представляли собой характерный и недифференцированный бактериом и отличались от бактериома, обнаруженного в образцах фекалий или в начале желудочно-кишечного тракта (ротовая полость (OC)). Образцы нижних отделов желудочно-кишечного тракта и фекалии пациентов со СпА демонстрировали поведение, аналогичное микробиоте группы ВЗК, с меньшим микробным богатством и разнообразием по сравнению со здоровым контролем. Интересно, что у больных СпА было обнаружено увеличение количества провоспалительных таксонов, таких как семейство Enterobacteriaceae (преимущественно в подвздошной кишке), Succinivibrio spp. и Prevotella stercorea. И наоборот, у пациентов со СпА наблюдалось значительное снижение количества продуцентов SCFAs Coprococcus catus и Eubacterium biforme. Наши данные подтверждают ценность образцов CAL для регионального исследования желудочно-кишечного тракта и содержат информацию о потенциальных «таксонах-разрушителях», участвующих в расстройствах, связанных с желудочно-кишечным трактом, наблюдаемых у пациентов со СпА.

Изменения микробиома (дисбиоз) в желудочно-кишечном тракте связаны с различными патологиями, имеющими серьезные последствия для здоровья и благополучия. В некоторых случаях эти изменения микробиома могут быть следствием системных и дегенеративных заболеваний, таких как СпА, группа ревматических заболеваний, тесно связанных с внекишечными проявлениями и желудочно-кишечными симптомами1, при этом неоспоримо, что заболеваемость СпА увеличивается у пациентов с субклиническим кишечным расстройством. воспаление2. Даже у серонегативных пациентов со СпА с неспецифическими желудочно-кишечными симптомами наблюдаются субклинические кишечные воспаления, определяемые по данным илеоколоноскопии3.

Сообщалось также о причинно-следственной связи, связанной с генетической предрасположенностью, при которой дисбиоз или простое присутствие патогенных бактерий может вызвать обострение иммунного ответа, способствующего развитию некоторых аутоиммунных заболеваний, таких как воспалительные заболевания кишечника (ВЗК), проявление которых тесно связано с генетической предрасположенностью. связанный со SpA4,5. Многочисленные исследования были направлены на описание состава микробиоты кишечника и его роли в развитии и прогрессировании SpA6,7, однако последствия дисбактериоза, наблюдаемого в кишечнике этих пациентов, не совсем понятны8. Несмотря на разногласия, микробиота кишечника, по-видимому, имеет важное значение для развития этих патологий.

Кишечный микробиом имеет чрезвычайно разнообразный состав: бактериальное разнообразие варьируется от 500 до 1000 видов9. Внедрение технологий массового секвенирования на основе ПЦР (т. е. секвенирования генов 16S рРНК) позволило более широко понять микробные сообщества и способствовало описанию «здорового» или «нездорового» микробиома. Для изучения микробного состава кишечника можно использовать различные виды образцов, например, стул или биопсию желудочно-кишечного тракта (ЖКТ). Наиболее часто используется стул из-за легкости и отсутствия риска во время сбора10, тем не менее, состав микробиома варьируется в зависимости от местоположения в желудочно-кишечном тракте.

Биопсия, лазерная микродиссекция, просветная щетка и другие альтернативы региональному исследованию желудочно-кишечного тракта, которые предлагают наиболее точное описание микробиоты10. Однако даже несмотря на то, что, когда требуется инвазивная процедура (например, колоноскопия), биопсия (или микродиссекция с лазерным захватом) требуется только в случае выявления аномальных тканей, что затрудняет получение достаточного количества образцов в контексте исследований СпА. В дополнение к этому, колоноскопию назначают только нездоровым людям, а, учитывая риски и сложность процедур колоноскопии, привлечение здоровых людей из контрольной группы всегда затрудняет разработку клинических исследований. Все эти причины побудили исследования микробиоты кишечника использовать фекалии в качестве показателя состава кишечного микробиома, в основном как представления дистальной части желудочно-кишечного тракта11. Лишь немногие исследования включают более проксимальные участки, такие как тонкая кишка, из-за сложности доступа к этой части, несмотря на то, что это один из наиболее пораженных отделов в контексте SpA12.